分離的基本依據：極性差異、酸性強弱、分子大小和特殊結構。

　　1、溶劑萃取法

　　2、PH梯度法：用不同濃度的堿分離

　　3、柱色譜法

　　（1）硅膠柱色譜法

　　適于分離異黃酮，二氫黃酮（醇）和高度甲基化或乙酰化的黃酮及黃酮醇類。

　　分離苷元時：氯仿-甲醇混合溶劑洗脫。

　　分離苷時：氯仿-甲醇-水或乙酸乙酯-丙酮-水。

　　（2）聚酰胺柱色譜

　　適于黃酮類化合物的分離。

　　原理：氫鍵吸附學說，即聚酰胺的吸附作用是通過其酰胺羰基與黃酮類化合物上的酚羥基形成氫鍵締合而產生的，其吸附強度取決于黃酮類化合物分子中酚槍擊的數目與位置等及溶劑于黃酮類化合物，或與聚酰胺之間形成氫鍵鍗合能力的大小。