立克次體為多形態，球桿狀或桿狀，0.3～0.6×0.8～2.0um.柯克斯體最小，平均大小為0.25×1um，多形性更明顯。最大者為斑點熱群，為0.6×1.2um.在感染細胞內，立克次體常聚集成致密團塊狀，但也可成單或成雙排列。不同立克次體在細胞內的分布不同，可供初步識別。如普氏立克次體常散在于胞質中，恙蟲病立克次體在胞質近核旁，而斑點熱群立克次體則在胞質和核內均可發現。

　　革蘭氏染色陰性，但一般著染不明顯，因此常用Giemnez、Giemsa 或Macchiavello法染色，其中以Gimenez法最好。該法著染后，除恙蟲病立克次體呈暗紅色外，其他立克次體均呈鮮紅色。Giemsa法和Macchiavello法分別將立克次體染成紫或藍色和紅色。

　　立克次體在結構上與革蘭氏陰性桿菌非常相似。用電子顯微鏡觀察，最外層為由多糖組成的粘液層，有粘附宿主細胞及抗吞噬作用。其內為微莢膜或稱外包膜，由多糖或脂多糖組成。細胞壁包括外膜（磷脂雙分子層）、肽聚糖及蛋白脂類三層。有與細菌內毒素性質相似的脂多糖復合物，但脂類含量比一般細菌高得多。胞漿膜為雙層類脂，主要由磷脂組成。胞質內有核糖體（由30s和50s兩個亞基組成）。核質集中于中央，含雙股DNA。