流腦流行期間，根據典型癥狀和體征不難診斷。對散發的或不典型病例，可采取瘀斑中血液、外周血液或腦脊液送檢。帶菌者可用末端2cm處彎曲的棉拭，深入口腔，直達懸雍垂后鼻咽腔部，小心旋轉采取分泌物送檢。

　　1.直接染色鏡檢

　　在瘀斑處采取血液或組織液，經美藍染色，如找到腎形革蘭氏陰性雙球菌，可作初步報告。對腦脊液標本，離心取沉淀物制備涂片，用革蘭氏染色或美蘭染色鏡檢，在多形核細胞中找到腎形雙球菌，結合臨床癥狀即可確診，也可用免疫熒光法直接查菌體。

　　2.分離培養

　　對無菌采取的瘀血斑或腦脊液先行葡萄糖肉湯增菌，或直接接種于巧克力血平板或卵黃雙抗瓊脂平板上，5～10%CO2環境下，培養18～24小時，觀察結果。

　　3.血清學檢查

　　可用間接血凝試驗，ELISA等方法檢測流腦抗體，以輔助診斷。